Впервые упоминается в 1382 как селение Пудога, затем — Пудожский погост. Уездным городом Олонецкой губернии стал 16 мая 1785 года по указу Екатерины II. С конца XVIII в. в устье р. Водла действовало несколько стекольных заводов, с конца XIX в. — лесопильные заводы.
16 мая 1785 года по указу Екатерины II стал уездным городом Олонецкого наместничества. В том же году Пудож посетил олонецкий губернатор Г. Р. Державин. В связи с упразднением Олонецкого наместничества, в 1796 году приписан заштатным городом к Архангельской губернии. В 1801 году стал уездным городом образованной Олонецкой губернии.
С конца XVIII века в устье реки Водла действовало несколько стекольных заводов, с конца XIX века — лесопильные заводы. В 1902 году в Пудоже появилась первая телефонная линия.
25 января 1905 года в Пудоже была организована первая политическая демонстрация. 9 политических ссыльных с жёнами вышли на городские улицы. Они надели траурные повязки, тем самым выразив свой протест против событий 9 января 1905 года в Петербурге («Кровавое воскресенье»).
В начале Гражданской войны большевики прилагали усилия к созданию боеспособных частей Красной армии. В 1918 году в Пудоже формированием добровольческих отрядов «красных» занимались члены ВКП(б) Н. Г. Куделин и Ф. М. Перепёлкин. Но крестьяне не желали служить в Красной армии. На этой почве в январе 1919 года в Пудоже произошло восстание (всед за восстаниями декабря 1918 года в других районах Карелии). Восставших удалось уговорить и отправить в Петрозаводск, где они были включены в состав маршевых рот, направлявшихся на фронт.
В сентябре 1922 года, после упразднения декретом ВЦИК РСФСР Олонецкой губернии, территория Пудожского уезда была включена в состав Карельской Трудовой Коммуны.
В 1956 году на окраине Пудожа был построен новый аэропорт: асфальтовая взлетно-посадочная полоса, аэровокзал, служебные помещения.
По материалам Википедии